Clã Inuzuka

História
É um clã do País do Fogo respeitado, com a peculiaridade de utilizar cachorros como companheiro nas lutas. O ninja recebe seu cão ainda pequeno. Os dois começam a criar uma existência amigável, até ao ponto do ninja entender o que o seu mascote tenta expressar por latidos e gestos. Os dois desenvolvem a confiança entre si.

A luta de um ninja desse clã é sempre fruto de uma aliança entre homem e cão. O cão, quase sempre grande, ataca com força bruta, com a ajuda da força e da estratégia do ninja. Para melhorar sua técnica, o ninja luta como se fosse um animal, aumentando o seu olfato com o acúmulo de chakra na região do nariz, lutando quase sempre de quatro, deixando os seus dentes afiados. Na hora da luta, os dois lutam de forma sincronizada. Para melhorar sua habilidade, é comum o uso de Pílulas do Soldado, que aumenta consideravelmente a força dos dois.

Técnicas do clã
Os jutsus conhecidos usados pelo clã são: Bakuretsu Koinu, Juujin Bunshin, Konbi Henge no Jutsu, Shikyaku no Jutsu, Inuzuka Ryuu Chinjuu Konbi Henge: Soutou Rou, Garouga , Gatsuuga e Tsuuga

- Clã Kaguya

História
O Clã Kaguya era um clã muito poderoso no país da água,na vila oculta da névoa, por causa de sua Kekkei Genkai. Sempre que começava uma guerra era utilizados, o que fez seus membros ganharem um certo prazer nas lutas. Viraram um clã militar, com interesse apenas na guerra. Se deliciaram com as batalhas da Terceira Guerra Secreta. Quando ela acabou, os membros desse clã queriam mais, e pensaram em dar um golpe militar em um período de instabilidade da vila da névoa. Juntaram todos e invadiram. Foram massacrados. Somente o jovem Kaguya Kimimaro sobreviveu e se aliou a Orochimaru ( que tinha o interesse de se apossar de seu corpo quando estivesse pronto).

Sua Kekkei Genkai, Shikotsu Myaku (Passagem dos Ossos do Corpo), permite que o ninja controle livremente os ossos de seu corpo. Ele pode retirar o osso de seu braço e utilizá-lo como arma ou um escudo, ou ainda os dois simultaneamente; atirar pedaços dos ossos para atacar o oponente. Tudo isso somado à rápida recuperação dos ossos faz com que o ninja ataque e se defenda ao mesmo tempo. Normalmente, a limitação desse controle varia de pessoa para pessoa, alguns nascendo com mais controle do que os outros. Mesmo assim, essa Kekkei Genkai traz limitações: pela complexidade do corpo do usuário, raramente um tratamento normal fará resultado. E ainda tem a possibilidade de uma doença rara aparecer nessa pessoa, o que significa a morte dela.
As técnicas próprias dessa Kekkei Genkai, logo, únicas desse clã, são: Karamatsu no Mai, Sawarabi no Mai, Tessenka no Mai, Tsubaki no Mai, Yanagi no Mai.

- Clã Kamizurui

O Clã Kamizurui é um clã de usuários de insetos da Vila Oculta da Pedra, no País da Terra. Há muito tempo eles eram quase tão famosos quanto o Clã Aburame, mas agora o clã foi esquecido, e atualmente estão em pequena quantidade. Este clã só aparece no Anime, quando três membros estão numa importante missão: capturar o Bikouchuu para a restauração do clã. O Clã Kamizurui tem uma certa "rivalidade" com o Clã Aburame (Clã Aburame foi o responsável pela queda do Clã Kamizurui) e agora eles querem vingança. Suas técnicas conhecidas são:

-Invisibilidade (camuflagem perfeita);
-Hachimitsu Bunshin no Jutsu - Um Clone de mel;
-Ninpou, Hachimichi no Jutsu - Técnica da Conjuração da Abelha -, que o usuário conjura várias abelhas (falsas) que soltam um mel forte o suficiente para aprisionar o inimigo (que se parece com uma cola laranja), e após isso, o usuário conjura uma última abelha (verdadeira) para adormecer o inimigo;
-Hachi Senbon no Jutsu - Mil Ferrões de Abelha -, o usuário conjura várias abelhas, que por sua vez, soltam milhares de ferrões venenosos (se parecem com agulhas);
-Invocação de larvas de abelhas, que comem (sugam) o chakra do inimigo;
-Kuchiyose no Jutsu: Joohachi - o usuário usa esse Jutsu e invoca uma abelha gigante .
-Hachi Bakudan no Jutsu - Ataque das Abelhas Bomba -, o usuário conjura várias abelhas, que por sua vez, explodem.
-Hachimitsu no Jutsu - Ataque de Mel -, o usuário conjura várias abelhas, que por sua vez, soltam um mel para aprisionar o inimigo.

Quando o Clã Kamizurui estava no mesmo nível do Clã Aburame, na época do avô de Aburame Shino, eles (alguns shinobis da Vila Oculta da Pedra - shinobis Kamizurui's) tentaram invadir Konoha. Eles trouxeram um exército de abelhas para a vila, e planejaram atacar em meio à confusão. Mas o Clã Aburame percebeu a tentativa de ataque, e esperou na floresta dos insetos. Deu-se a luta, com a vitória do Clã Aburame. Mais de mil pessoas foram mortas na batalha, mas em contrapartida, o Clã Kamizurui perdeu sua fama, mesmo dentro da Vila Oculta da Pedra. Agora, os membros conhecidos (abaixo) tentam capturar o Bikouchuu com o intuito de achar o pergaminho secreto (existem técnicas nele que são até proibidas, mesmo para os usuários de insetos), do primeiro usuário do Clã - o fundador.
Membros Conhecidos: Kamizurui Kurobachi; Kamizurui Suzumebachi (neta do Primeiro usuário do Clã Kamizurui); Kamizurui Jibachi

- Clã Koori

Clã Koori é o suposto Clã a quem Haku é membro, assim como sua mãe. Após a guerra cíviu no País da Água, todos se revoltarem contra o herdeiros de Kekkei Genkai, os Koori possuem o Hyouton que permite manipular gelo e facilidade com jutsu de Suiton (Água), no que também incluirá esse clã, assim como os Kaguya, a partir daí, todos os membros desse clã passaram a se esconder e nunca revelar sua Kekkei Genkai ou a existencia desse clã, apenas Haku e sua mãe são os membros conhecidos, os membros do clan tiveram de se esconder devido ao medo das pessoas em relação a este clan. Desde este momento houve uma guerra civil entre o País da Água e as pessoas de linhagem sanguínea avançada. Os rumores diziam que esta guerra começou com o Clan Kaguya. Este clã misterioso o qual conhecemos apenas dois membros parece ter a habilidade de manipular a água e transforma-la em gelo, e também a estranha habilidade de fazer jutsus com apenas uma mão. Podendo manipular água desta maneira, eles usam jutsus que apenas sua linhagem é capaz, como os Espelhos de Gelo Demoníacos e as Agulhas voadoras Aquáticas.
Membros conhecidos: Haku e sua mãe

- Clã Kurama

Clã originario de Konoha. Algumas gerações de membros do clã Kurama nasceram com o incrível talento para genjutsu. Seus genjustu são completamente irresistíveis, tanto que somente uma pessoa de fora pode tirá-la do transe. Além do mais, o genjutsu é tão poderoso que faz o cérebro crer que o que ocorre com a vítima no genjutsu é real e se manifesta no corpo dela, permitindo a um membro do clã potencialmente matar seus oponentes com genjutsu. Contudo, o usuário raramente controla a extenção total das suas habilidades, e com tal seu subconsciente irá geralmente regular esse poder, podendo surgir uma segunda personalidade que controla este poder. Esta personalidade então sobrepõe a original, transformando o indivíduo num monstro que é perigoso a todos que estiverem ao seu redor.

- Clã Nara 

História
Não é um clã muito famoso nem grande. Na história de Konoha, é lembrado por deter um conhecimento medicinal excepcional. Tsunade recorreu a tal conhecimento para poder salvar Akimichi Chouji.No entanto, é mais conhecido por suas técnicas eram usadas para segurar um ninja, enquanto chegava o time de apoio para ajudá-lo. Por isso, suas técnicas nunca foram próprias para batalha. Quando acontece do ninja desse clã entrar num combate direto, ele sempre tinha dificuldades. Para evitar problemas, o intelecto do ninja é treinado, para facilitar a criação de estratégias. Os membros conhecidos são Nara Shikato e Nara Shikamaru.

Técnicas do clã
A manipulação de sombras é limitada, porém útil. O ninja estende a sua sombra para fazer diferentes técnicas. Pode aumentar consideravelmente o alcance se ele usar a sombra de objetos. Ela é facilmente modelável, pode ficar grossa ou fina, porém o alcance dela é sempre o mesmo. Com o Kage Mane no Jutsu o ninja pode prender o oponente, se sua sombra esticada encostar na do oponente. Usando o Kage Kubi Shibari no Jutsu aliado ao Kage Mane o ninja estica sua sombra sobre o oponente preso, criando uma mão que enforca-o. Outra técnica é o Kage Nui, onde o ninja divide sua sombra em várias partes, criando vários chicotes, que cortam tudo que encostam.

- Clã Uzumaki 

História
Esse clã vem do extinto País do Redemoinho, da Vila Oculta do Redemoinho (Uzumakigakure no Sato), a qual foi destruída durante a Terceira Grande Guerra Ninja. Curiosamente, todos os habitantes dessa vila eram do mesmo clã. As habilidades do clã, como o próprio nome sugere, são baseadas na capacidade de concentrar grandes quantidades energia através do giro concêntrico de chackra (redemoinhos de chackra). A mãe de Naruto,Uzumaki Kushina, foi quem primeiro trouxe o clã para Konoha, e aparentemente Naruto é o unico remanscente de seu clã. Naruto viveu sem seus pais. Desde que nasceu viveu sozinho em sua casa e foi menosprezado por todos de Konoha e agora quer ser um ninja (Hokage)e ser respeitado por todos

- Clã Yamanaka

Jutsus e História
O clã que possui jutsus usados para controlar e afetar o corpo e a mente das pessoas. A técnica mais conhecida é Ninpou Shintenshin no Jutsu onde o ninja atira sua mente. Se acertar alguém, ele toma controle do corpo dessa pessoa, perdendo o controle do seu; se errar, vai demorar até voltar, e ele estará desprotegido. A pessoa pode fazer o que quiser com o corpo dominado, mas qualquer machucado que o corpo sofrer o original do ninja sofre também. Esse ninjutsu ganhou fama após as guerras ocultas pelo fato dos ninjas do clã terem espionado e coletado Informações para Komoha dando fama ao clã. Outro ninjutsu usado pelo clã Yamanaka é o Shinranshin no Jutsu, onde o oponente é confundido e obrigado a lutar contra seu companheiro. Apesar de saber o que está fazendo, ele não pode parar. Também são conhecidos pois o clã possui uma loja de flores em Konoha chamada Yamanaka Flower Shop.
Os membros conhecidos e mostrados no anime/mangá são: Yamanaka Ino e Yamanaka Inoshi.